Tienes varias opciones:
Hay programas que activas el click en grabar o reproducir, puedes hacer una precuenta como quieras y algunos tienen la opción "RENDER", esto significa que cuando puedes aplicar al tema el click convirtiéndolo en sonido, ósea, metes el mp3 al programa, buscas el tempo y generas el click y pones RENDER y te hará una copia del tema con el click, tu decides si lo quieres a la izquierda o derecha, el volumen y el sonido del Click. No se con que programas trabaja tu pero yo lo puedo hacer con Studio. One.
O puedes optar por la opción "Manual" como hacia yo en mis inicios:
Oyes la música con audífonos y mientras te grabas aplaudiendo al ritmo del tema, o chasqueando los dedos, o hasta contando si quieres. Esto por un par de compases, no necesitas hacerlo en todo el tema. Luego colocas el canal donde aplaudiste y lo sincronizas con la música en el Programa y listo, sólo quedaría copiar y pegar las veces que sean necesarias.
Para esta última opción puedes usar prácticamente cualquier programa, es meter el tema, grabarte aplaudiendo y sincronizar.